MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1

Total Repeats: 106483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020800	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	470469930
2	NC_020800	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	470469930
3	NC_020800	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
4	NC_020800	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
5	NC_020800	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	470469930
6	NC_020800	CG	3	6	276	281	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
7	NC_020800	GC	3	6	316	321	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
8	NC_020800	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
9	NC_020800	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
10	NC_020800	CA	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	470469930
11	NC_020800	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
12	NC_020800	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
13	NC_020800	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
14	NC_020800	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
15	NC_020800	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
16	NC_020800	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469930
17	NC_020800	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
18	NC_020800	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
19	NC_020800	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
20	NC_020800	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
21	NC_020800	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469930
22	NC_020800	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
23	NC_020800	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469930
24	NC_020800	CG	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
25	NC_020800	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	470469930
26	NC_020800	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469930
27	NC_020800	CG	3	6	870	875	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
28	NC_020800	GC	3	6	894	899	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
29	NC_020800	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
30	NC_020800	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469930
31	NC_020800	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469930
32	NC_020800	GC	3	6	979	984	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
33	NC_020800	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469930
34	NC_020800	CTG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
35	NC_020800	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469930
36	NC_020800	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469930
37	NC_020800	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
38	NC_020800	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469930
39	NC_020800	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	470469930
40	NC_020800	GC	3	6	1176	1181	0 %	0 %	50 %	50 %	470469930
41	NC_020800	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	470469930
42	NC_020800	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469930
43	NC_020800	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469931
44	NC_020800	GC	3	6	1857	1862	0 %	0 %	50 %	50 %	470469931
45	NC_020800	GC	3	6	1880	1885	0 %	0 %	50 %	50 %	470469931
46	NC_020800	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469931
47	NC_020800	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
48	NC_020800	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470469931
49	NC_020800	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469931
50	NC_020800	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469931
51	NC_020800	GC	3	6	2435	2440	0 %	0 %	50 %	50 %	470469931
52	NC_020800	GC	3	6	2524	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	470469931
53	NC_020800	AGG	3	9	2542	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470469931
54	NC_020800	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
55	NC_020800	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469931
56	NC_020800	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469931
57	NC_020800	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469932
58	NC_020800	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469932
59	NC_020800	GTGGA	2	10	4012	4021	20 %	20 %	60 %	0 %	470469932
60	NC_020800	AAG	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469932
61	NC_020800	GCG	3	9	4028	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469932
62	NC_020800	GGCT	2	8	4059	4066	0 %	25 %	50 %	25 %	470469932
63	NC_020800	CT	3	6	4128	4133	0 %	50 %	0 %	50 %	470469932
64	NC_020800	TGCGC	2	10	4135	4144	0 %	20 %	40 %	40 %	470469932
65	NC_020800	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469932
66	NC_020800	GGT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469932
67	NC_020800	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469932
68	NC_020800	AAC	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469932
69	NC_020800	GC	3	6	4313	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	470469932
70	NC_020800	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470469932
71	NC_020800	GCGTGA	2	12	4527	4538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470469932
72	NC_020800	CAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469932
73	NC_020800	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469932
74	NC_020800	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469932
75	NC_020800	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469932
76	NC_020800	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
77	NC_020800	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
78	NC_020800	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
79	NC_020800	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
80	NC_020800	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
81	NC_020800	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
82	NC_020800	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469933
83	NC_020800	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
84	NC_020800	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
85	NC_020800	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
86	NC_020800	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
87	NC_020800	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
88	NC_020800	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
89	NC_020800	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
90	NC_020800	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	470469933
91	NC_020800	GGCGC	2	10	5607	5616	0 %	0 %	60 %	40 %	470469933
92	NC_020800	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	470469933
93	NC_020800	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
94	NC_020800	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
95	NC_020800	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
96	NC_020800	GGC	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
97	NC_020800	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
98	NC_020800	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469933
99	NC_020800	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469933
100	NC_020800	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
101	NC_020800	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	470469933
102	NC_020800	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
103	NC_020800	CG	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
104	NC_020800	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
105	NC_020800	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
106	NC_020800	GC	3	6	6112	6117	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
107	NC_020800	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	470469933
108	NC_020800	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
109	NC_020800	CG	3	6	6183	6188	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
110	NC_020800	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
111	NC_020800	GCG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
112	NC_020800	GC	3	6	6211	6216	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
113	NC_020800	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
114	NC_020800	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
115	NC_020800	CCGCAA	2	12	6354	6365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470469933
116	NC_020800	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
117	NC_020800	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
118	NC_020800	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469933
119	NC_020800	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469933
120	NC_020800	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469933
121	NC_020800	CCGACG	2	12	6539	6550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470469933
122	NC_020800	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
123	NC_020800	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469933
124	NC_020800	CTACAT	2	12	6624	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469933
125	NC_020800	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
126	NC_020800	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
127	NC_020800	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
128	NC_020800	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
129	NC_020800	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469933
130	NC_020800	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470469933
131	NC_020800	CG	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
132	NC_020800	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
133	NC_020800	CG	3	6	6981	6986	0 %	0 %	50 %	50 %	470469933
134	NC_020800	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469933
135	NC_020800	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
136	NC_020800	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469933
137	NC_020800	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469933
138	NC_020800	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469933
139	NC_020800	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469933
140	NC_020800	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
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142	NC_020800	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
143	NC_020800	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469933
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148	NC_020800	CTG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
149	NC_020800	GGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469934
150	NC_020800	GCC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
151	NC_020800	GCT	2	6	7786	7791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
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155	NC_020800	CG	3	6	7885	7890	0 %	0 %	50 %	50 %	470469934
156	NC_020800	CGC	3	9	7924	7932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
157	NC_020800	CTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
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163	NC_020800	CTG	2	6	8087	8092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469934
164	NC_020800	GCC	2	6	8126	8131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469934
165	NC_020800	GAGCG	2	10	8155	8164	20 %	0 %	60 %	20 %	470469934
166	NC_020800	CGGCC	2	10	8206	8215	0 %	0 %	40 %	60 %	470469934
167	NC_020800	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469934
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169	NC_020800	CAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469934
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228	NC_020800	AAC	2	6	10990	10995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470469937
229	NC_020800	CACTG	2	10	11087	11096	20 %	20 %	20 %	40 %	470469937
230	NC_020800	ATG	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469937
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239	NC_020800	CGC	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
240	NC_020800	CCG	2	6	11346	11351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
241	NC_020800	CCG	2	6	11355	11360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
242	NC_020800	CCG	2	6	11364	11369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
243	NC_020800	CCG	2	6	11415	11420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
244	NC_020800	CCG	2	6	11427	11432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
245	NC_020800	GTGGAT	2	12	11475	11486	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470469937
246	NC_020800	GTCG	2	8	11510	11517	0 %	25 %	50 %	25 %	470469937
247	NC_020800	GCA	2	6	11562	11567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469937
248	NC_020800	GCC	2	6	11610	11615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469937
249	NC_020800	TGC	2	6	11741	11746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469938
250	NC_020800	CGC	3	9	11760	11768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469938
251	NC_020800	CCT	2	6	11903	11908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470469938
252	NC_020800	TCA	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470469938
253	NC_020800	CAC	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469938
254	NC_020800	GAA	2	6	12022	12027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470469938
255	NC_020800	GCT	2	6	12076	12081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469938
256	NC_020800	CAC	2	6	12085	12090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469938
257	NC_020800	GC	3	6	12093	12098	0 %	0 %	50 %	50 %	470469938
258	NC_020800	GCA	2	6	12104	12109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469938
259	NC_020800	TCG	2	6	12146	12151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469938
260	NC_020800	TCG	2	6	12242	12247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469938
261	NC_020800	GC	3	6	12278	12283	0 %	0 %	50 %	50 %	470469938
262	NC_020800	GGTG	2	8	12336	12343	0 %	25 %	75 %	0 %	470469938
263	NC_020800	TCG	2	6	12374	12379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469938
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265	NC_020800	CTT	2	6	12471	12476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470469938
266	NC_020800	CG	3	6	12488	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	470469938
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379	NC_020800	CGC	2	6	18599	18604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470469945
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386	NC_020800	CAG	2	6	18860	18865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470469945
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388	NC_020800	TGA	2	6	19033	19038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469945
389	NC_020800	TGC	2	6	19039	19044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470469945
390	NC_020800	CCA	2	6	19060	19065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470469945
391	NC_020800	GC	3	6	19105	19110	0 %	0 %	50 %	50 %	470469945
392	NC_020800	CGG	2	6	19132	19137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470469945
393	NC_020800	GGT	2	6	19169	19174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470469945
394	NC_020800	TGA	2	6	19186	19191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470469945
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